Zu Beginn der zweiten Staffel reisen Peter (Neil Napier), Sarah (Jordan Hayes) und Dr. Kyle (Matt Long) zu einer tropischen Insel, auf der sich eine neue unbekannte Krankheit ausgebreitet hat. Von Bruder Michael (Steven Weber) werden sie zu einer sicheren Basis gebracht. Währenddessen befindet sich Julia (Kyra Zagorsky) auf derselben Insel, nur 30 Jahre in der Zukunft, wo sie Alans Grab betrachtet.